Effect of polymorphisms in exon 8 of the PPARGC1A gene on milk production traits in cattle
| dc.contributor.author | Śpiewak, Magdalena | |
| dc.contributor.author | Kowalewska, Inga | |
| dc.contributor.author | Czerniawska-Piątkowska, Ewa | |
| dc.contributor.organization | Department of Genetics, Faculty of Biotechnology and Animal Breeding, West Pomeranian University of Technology, Szczecin, Poland | |
| dc.contributor.organization | Department of Genetics, Faculty of Biotechnology and Animal Breeding, West Pomeranian University of Technology, Szczecin, Poland | |
| dc.contributor.organization | Department of Ruminant Science, Faculty of Biotechnology and Animal Breeding, West Pomeranian University of Technology, Szczecin, Poland | |
| dc.date.accessioned | 2024-03-04T12:07:47Z | |
| dc.date.available | 2024-03-04T12:07:47Z | |
| dc.date.issued | 2023 | |
| dc.description.abstract | The objective of this study was to investigate associations between genotypes of polymorphisms in exon 8 of the PPARGC1A gene and milk production traits in dairy cattle. The study was conducted in a herd of 959 Polish Holstein-Friesian of the black and white cows kept in western Poland. In this study, three polymorphisms within exon 8 of the PPARGC1A gene were analyzed: rs445204772, rs109164431 and rs133669403 and they are responsible for two missense and one synonymous type mutations. All cows were genotyped using the PCR-RFLP method. The PPARGC1A polymorphisms that were studied had the following major allele frequencies: rs445204772 – allele A 0.523; rs109164431 – allele C 0.607 and rs133669403 – allele A 0.546. Statistical analysis was aimed at estimating the effect of individual genotypes on milk performance traits such as milk, protein, and fat yield as well as protein and fat content in milk. For rs445204772 polymorphism, a statistically significant effect on milk yield (P ≤ 0.05) and fat content (P ≤ 0.05, P ≤ 0.01) was observed. Polymorphism rs109164431 significantly (P ≤ 0.05, P ≤ 0.01) affected milk, fat, and protein yield as well as milk fat content. In the case of polymorphism rs133669403, it was found that it affects to a different degree (P ≤ 0.05, P ≤ 0.01) most of the analyzed milk performance traits. The obtained results may contribute to the state of knowledge regarding the identification of the most important SNPs that could be used for the selection of marker assisted dairy cattle. | en |
| dc.description.abstract | Celem pracy było zbadanie związków pomiędzy genotypami polimorfizmów w eksonie 8 genu PPARGC1A a cechami użytkowości mlecznej bydła. Badania przeprowadzono w stadzie 959 krów rasy polskiej holsztyńsko-fryzyjskiej odmiany czarno-białej utrzymywanych w zachodniej Polsce. W niniejszym badaniu przeanalizowano trzy polimorfizmy w eksonie 8 genu PPARGC1A: rs445204772, rs109164431 i rs133669403, które są odpowiedzialne za dwie mutacje zmiany sensu i jedną mutację synonimiczną. Wszystkie krowy genotypowano metodą PCR-RFLP. Badane polimorfizmy PPARG-C1A miały następujące frekwencje głównych alleli: rs445204772 – allel A 0,523; rs109164431 – allel C 0,607 i rs133669403 – allel A 0,546. Celem analizy statystycznej było oszacowanie wpływu poszczególnych genotypów na wybrane cechy użytkowości mlecznej bydła takie jak wydajność mleka, białka i tłuszczu oraz zawartość białka i tłuszczu w mleku. Dla polimorfizmu rs445204772 zaobserwowano statystycznie istotny wpływ na wydajność mleka (P ≤ 0,05) i zawartość tłuszczu (P ≤ 0,05, P ≤ 0,01). Polimorfizm rs109164431 istotnie (P ≤ 0,05, P ≤ 0,01) wpłynął na wydajność mleka, tłuszczu i białka oraz zawartość tłuszczu w mleku. W przypadku polimorfizmu rs133669403 stwierdzono, że wpływa on w różnym stopniu (P ≤ 0,05, P ≤ 0,01) na większość analizowanych cech użytkowości mlecznej. Uzyskane wyniki mogą przyczynić się do poszerzenia stanu wiedzy dotyczącej identyfikacji najważniejszych SNP, które mogłyby być wykorzystane w selekcji bydła mlecznego wspomaganego markerami. | pl |
| dc.identifier.citation | Śpiewak M., Kowalewska I., Czerniawska-Piatkowska E. (2023) Effect of polymorphisms in exon 8 of the PPARGC1A gene on milk production traits in cattle, Folia Pomer. Univ. Technol. Stetin., Agric,. Aliment., Pisc., Zootech., 366(65)1, 97-105. doi 10.21005/AAPZ2023.65.1.8 | en |
| dc.identifier.doi | 10.21005/AAPZ2023.65.1.8 | |
| dc.identifier.eissn | 2300-5378 | |
| dc.identifier.issn | 2081-1284 | |
| dc.identifier.uri | http://hdl.handle.net/20.500.12539/1946 | |
| dc.language.iso | en | |
| dc.page.number | 97-105 | |
| dc.publisher | Wydawnictwo Uczelniane Zachodniopomorskiego Uniwersytetu Technologicznego w Szczecinie | pl |
| dc.relation.ispartofseries | Agricultura, Alimentaria, Piscaria et Zootechnica | |
| dc.rights | Attribution-NonCommercial 3.0 Poland | en |
| dc.rights.uri | http://creativecommons.org/licenses/by-nc/3.0/pl/ | |
| dc.subject | lactation | en |
| dc.subject | single nucleotide polymorphisms | en |
| dc.subject | Polish Holstein-Friesian cattle | en |
| dc.subject | laktacja | pl |
| dc.subject | polimorfizm pojedynczego nukleotydu | pl |
| dc.subject | bydło rasy polskiej holsztyńsko-fryzyjskiej | pl |
| dc.subject.other | zootechnika i rybactwo | pl |
| dc.title | Effect of polymorphisms in exon 8 of the PPARGC1A gene on milk production traits in cattle | en |
| dc.title.alternative | Wpływ polimorfizmów w eksonie 8 genu PPARGC1A w odniesieniu do cech użytkowości mlecznej bydła | pl |
| dc.type | Article | en |