FTO and PLIN2 Genes Polymorphism in Relation to Growth Traits of Pigs

Abstract

FTO and PLIN2 genes are considered as a markers for fat-related traits in pigs. However, high expression of these genes in muscle tissues and earlier studies suggest, that they can be also associated with growth. Therefore the aim of this study was to analyze polymorphism in FTO (g.400C > G) and PLIN2 (g.98G > A) genes in relation to growth traits in pigs. The study were conducted on 578 sows including following breeds: Duroc, Hampshire, Polish Landrace, Pietrain, Puławska and Polish Large White. FTO and PLIN2 genes polymorphism was determined by use PCR-RFLP and ACRS-PCR methods respectively. Association analysis was performed for Polish Landrace, Puławska and Polish Large White separately and for joined group of 6 breeds. The results show that FTO genotypes were related only to test daily gain in Polish Large White pigs (p < 0.05). PLIN2 gene variants, however were associated with test daily gain in Polish Landrace, Puławska (p < 0.01) and joined group (p < 0.05), average daily gain in Puławska (p < 0.01), feed:gain ratio in joined group (p < 0.05) and age at slaughter and number of days on test in Puławska (p < 0.01) and joined group (p < 0.01 and p < 0.05 respectively). Obtained results show that PLIN2 gene is more related to growth traits in pigs than FTO, but needs further analysis and explanation.

Geny FTO i PLIN2 są rozważane jako markery cech związanych z cechami otłuszczenia świń. Wysoka ekspresja tych genów w tkance mięśniowej i poprzednie badania sugerują, że mogą być one powiązane również ze wzrostem. W związku z powyższym celem niniejszych badań była analiza polimorfizmu w genach FTO (g.400C > G) i PLIN2 (g.98G > A), w odniesieniu do cech wzrostu świń. Badania przeprowadzono na 578 lochach ras: duroc, hampshire, polska biała zwisłoucha, pietrain, puławska i wielka biała polska. Polimorfizm genów FTO i PLIN2 został określony za pomocą metod PCR-RFLP i ACRS-PCR. Analizy zależności wykonano oddzielnie dla ras polska biała zwisłoucha, puławska i wielka biała polska oraz dla grupy łączącej 6 ras. Wyniki wykazały, że genotypy FTO były powiązane tylko z przyrostem dziennym świń rasy polska biała zwisłoucha (p < 0,05). Warianty genów PLIN2 były natomiast związane z przyrostem dziennym świń ras polska biała zwisłoucha, puławska (p < 0,01) i w grupie łączącej 6 ras (p < 0,01), ze średnim przyrostem dziennym świń rasy puławska (p < 0,01), ze zużyciem paszy na 1 kg przyrostu w grupie łączącej 6 ras (p < 0,05) i z wiekiem w dniu uboju, a także z liczbą dni tuczu w czasie testu świń rasy puławska (p < 0,01) i w grupie łączącej 6 ras (odpowiednio p < 0,01 i p < 0,05). Uzyskane wyniki wskazują, że gen PLIN2 jest bardziej powiązany z cechami wzrostu świń niż gen FTO; wymaga to jednak kolejnych analiz i wyjaśnienia.