QTL Analysis of Chlorophyll Content and Chlorophyll Fluorescence Parameter in Mapping Population of Rye

Molik, Katarzyna; Pawłowska, Edyta; Kantarek, Zuzanna; Milczarski, Paweł

QTL Analysis of Chlorophyll Content and Chlorophyll Fluorescence Parameter in Mapping Population of Rye

dc.contributor.author	Molik, Katarzyna
dc.contributor.author	Pawłowska, Edyta
dc.contributor.author	Kantarek, Zuzanna
dc.contributor.author	Milczarski, Paweł
dc.contributor.organization	Department of Plant Genetics, Breeding and Biotechnology, West Pomeranian University of Technology, Szczecin, Poland	en
dc.contributor.organization	Department of Plant Genetics, Breeding and Biotechnology, West Pomeranian University of Technology, Szczecin, Poland	en
dc.contributor.organization	Department of Plant Genetics, Breeding and Biotechnology, West Pomeranian University of Technology, Szczecin, Poland	en
dc.contributor.organization	Department of Plant Genetics, Breeding and Biotechnology, West Pomeranian University of Technology, Szczecin, Poland	en
dc.date.accessioned	2022-03-24T11:40:10Z
dc.date.available	2022-03-24T11:40:10Z
dc.date.issued	2014
dc.description.abstract	Zdefiniowano QTL dla zawartości chlorofilu (Chc) i maksymalnej fotochemicznej aktywności PSII (Fv/Fm) żyta. Materiał do badań stanowiła populacja RIL mieszańca międzyliniowego DS2 × RXL10, złożona z 70 osobników pokolenia F7. Otrzymane wyniki poddano analizie statystycznej; stwierdzono istotne zróżnicowanie obu cech u form rodzicielskich i osobników w populacji mapującej. Nie zaobserwowano istotnej statystycznie korelacji pomiędzy Chc a Fv/Fm; obliczone współczynniki odziedziczalności w szerokim zakresie (HB) wynosiły odpowiednio 56 i 53%. Przy LOD ≥ 2,0 wyznaczono 19 regionów QTL, w tym 9 dla zawartości chlorofilu i 10 dla całkowitej wydajności fotochemicznej PSII. Lokalizowały się one głównie w dystalnych lub centromerowych obszarach chromosomów: 1R, 3R, 5R, 6R, 7R, przy czym na chromosomach 1R, 5R i 6R znalazły się regiony wspólne dla QTL Fv/Fm1 i Fv/Fm5 (1R), Chc8 i Fv/Fm9 (5R) oraz Fv/Fm3 i Fv/Fm10 (6R). Otrzymane QTL dostarczają wstępnej wiedzy o dziedzicznym podłożu zawartości chlorofilu w życie i maksymalnej fotochemicznej aktywności PSII.	pl_PL
dc.description.abstract	The objective of the study was to identify QTLs for the chlorophyll content (Chc) and the maximum photochemical activity of PSII (Fv/Fm) in rye. RIL population of DS2 × RXL10 hybrid cross consisting of 70 individuals of F7 generation constituted as experimental material. The obtained results were subjected to statistical analysis, and significant differences in the diversity of both traits in parental phenotypes and individuals of mapping population, were shown. No statistically significant correlation between Chc and Fv/Fm was observed, and calculated broad sense heritabilities (HB) were estimated at 56 and 53% respectively. With LOD score ≥ 2.0, 19 QTL regions were established, including 9 for the content of chlorophyll and 10 for a total photochemical efficiency of PSII. They were mainly localized in the distal or centromeric regions of 1R, 3R, 5R, 6R, 7R chromosomes. On 1R, 5R and 6R common regions for QTLs were found: Fv/Fm1 and Fv/Fm5 (1R), Chc8 and Fv/Fm9 (5R) as well as Fv/Fm3 and Fv/Fm10 (6R). The resulting QTLs provide preliminary knowledge on hereditary basis of chlorophyll content and maximum photochemical activity of PSII in rye.	en
dc.identifier.citation	Molik K., Pawłowska E., Kantarek Z., Milczarski P. (2014). QTL Analysis of Chlorophyll Content and Chlorophyll Fluorescence Parameter in Mapping Population of Rye. Folia Pomer. Univ. Technol. Stetin., Agric., Aliment., Pisc., Zootech. 312(31), 105–116.	pl_PL
dc.identifier.eissn	2300-5378
dc.identifier.issn	2081-1284
dc.identifier.uri	https://hdl.handle.net/20.500.12539/1192
dc.language.iso	en	en
dc.page.number	105-116
dc.publisher	Wydawnictwo Uczelniane Zachodniopomorskiego Uniwersytetu Technologicznego w Szczecinie	pl_PL
dc.rights	Uznanie autorstwa-Użycie niekomercyjne 3.0 Polska	*
dc.rights.uri	http://creativecommons.org/licenses/by-nc/3.0/pl/	*
dc.subject	chlorophyll content	en
dc.subject	chlorophyll fluorescence	en
dc.subject	genetic mapping	en
dc.subject	rye	en
dc.subject	QTL	pl_PL
dc.subject	fluorescencja chlorofilu	pl_PL
dc.subject	mapowanie genetyczne	pl_PL
dc.subject	zawartość chlorofilu	pl_PL
dc.subject	żyto	pl_PL
dc.subject	QTL	en
dc.subject.other	Dyscyplina::Nauki rolnicze	pl_PL
dc.title	QTL Analysis of Chlorophyll Content and Chlorophyll Fluorescence Parameter in Mapping Population of Rye	en
dc.title.alternative	Analiza QTL zawartości chlorofilu i parametru fluorescencji chlorofilu w populacji mapującej żyta	pl_PL
dc.type	Article	en